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分辨「滅定識」非阿賴耶不成
頌言：「又入滅定識不離身，聖所說故。此中異熟識應成不離身，非為治此滅定生故。」

佛教「業感緣起」說，是論述生命的輪迴是由於業力的推動，業力的不失才有一期一期生命的相續不斷。結生相續的生命是「異熟果」，這個「異熟果」是建立在果報識上；在一期的生命中，它執持根身令其不壞不斷。

「滅受想定」，是聖者所修的「定」，這與外道凡夫所修的「無想定」不同。「滅受想定」是佛、不退菩薩及俱解脫阿羅漢遠離定障所得。契經中說，入「滅受想定」，雖然沒有受想，但「識」是不離身的；這個「識」不會是其他的「轉識」，因為其他的轉識是有間斷的，只有「異熟識」才會恆常地與色身共存，這個「識」就是「阿賴耶識」。再者，聖者修入「滅受想定」，目的在於對治粗動的「轉識」，所以轉識一定不會生起；而對於不離身的「異熟識」，是不會厭離或對治的。所以在大乘的主張，聖者修入「滅受想定」時，與色身共存的「異熟識」是不會有妨礙的。

再說，若果在「滅受想定」中有意識存在，受想與意識是不能脫離的，有意識就有受想心所。一般「意識」的所緣境和它的行相，是清晰明白的，但「滅定識」的所緣境和它的行相，是不像一般意識的明了可知，所以不可以說滅定中的「識」是意識。「滅受想定」是聖人的「定」，所以是善的，會與無貪等善根心所相應，而心識的本性是無記的，它必須與善心所相應，心識才能成為相應善。如果有善心所，這是非遍行心所，那麼遍行的「受想」也就應該存在，因為它們是與心不相離的。若有意識，有受想，也就應該有「觸」；由根境識三和合生觸，由觸的生起，才會有受想思等諸心所的生起。再說，入「滅盡定」，它還有「可意觸」或「中容觸」，不然的話，出定後不應該有這感覺。所以有「觸」，就應該有從「觸」所引起的覺受。於三摩地中，若果有觸受心所的功能，那麼，在定中亦會有「思」，就是「信、精進、念、定、慧」等善根也應該現行。更何況，「滅受想定」既稱為「無心定」，是不能說它有意識存在的。這樣的話，這個不離身的「識」，決定不會是第六意識，而是與色身共存的「異熟識」，即是「阿賴耶識」。

結成「阿賴耶識，決定是有」
頌言：「如是若離一切種子異熟果識，雜染清淨皆不得成，是故成就如前所說相阿賴耶識，決定是有。」

部派時期，熏習為種的說法，有主張「色心受熏」為種的，有主張「色心互持」種子的，有主張「心心所法受熏」為種的。主張「色心受熏」的，色心為種子，以為剎那剎那前色引後色，前心引後心。但在無色界沒有色，無心定沒有心的情況下，這色心的種子如何是好。主張「色心互持」種子的，這可避免了無色界沒有色，無心定沒有心（六識）的情況。無色界沒有色，但是有心，就以這心執持色法的種子；無心定雖沒有心，但還有色，就以這色執持心法的種子。大乘瑜伽學者認為這是不能成立的。假如從無色界歿，來生欲、色界的時候，久遠以前的色法已經斷滅了，那麼何來種子生起現在的色法。又有從無想天歿，或從二無心定出，心法在無想天及二無心定中，也是久已斷滅，那現在以何為「因」而生起心法。所以，若果接受有「阿賴耶識」攝持色心的種子，就沒有這樣的過失。又或者，阿羅漢的最後心，當剎那滅了以後，是不會再生起色心，他灰身泯智，入無餘依涅槃。若果以前剎那的色心為後剎那色心的種子，那麼，阿羅漢的最後心，不再生色心，也是不能成立的。因前念的色心望於後念的色心，只可容有「等無間緣」而不許它也有「親因緣」。這樣的話，阿羅漢是永遠不能入無餘涅槃了。這唯有把種子建立在賴耶中，才能因對治道的生起時，把染分的種子分分的除去，成為清淨，才能獲得「轉依」。對於「心心所法受熏」為種，大乘瑜伽行者不許它有心無所，所以說心是所依，心所是能依，拔除能依的心所令其離開所依，而留下所依的心王，這是不成道理的。因為心王與心所，無始時來，就互不相離，存在則二者一起存在，斷滅則二者一起斷滅的。所以，從上面所說的，安立「阿賴耶識」作為結身相續的「異熟識」是有的。

「轉依」非賴耶不成
頌言：「菩薩於淨心，遠離於五識，無餘，心轉依云何汝當作？若對治轉依，非斷故不成，果因無差別，於永斷成過。無種或無體，若許為轉依，無彼二無故，轉依不應理。」

從轉捨雜染依的見地來說，是可以證實非有賴耶不可的。聖人的淨心，是出世的清淨無漏心。在出世清淨無漏心現前的時候，聖人是一定已經遠離了所有有漏的眼、耳、鼻、舌、身等 「識」，其餘有漏善或無記的「意識」，也是不會生起的。這個時候，只有無漏的意識現前。在這個時候，如果沒有「阿賴耶識」攝持雜染種子，這個染心的「轉依」是不能安立的。在現行上說，「依他性」中的雜染分是分分的除去，轉顯成清淨分。在種子方面說，一切雜染分的熏習離去，清淨分漸漸的增到最清淨法界全體現前，具足一切功德，這也是叫做「轉依」。這是雜染依的有漏界徹底的不存在，轉得最清淨依的無漏法界，所以這轉依的寂滅，不但只是說捨染，還是說因捨雜染而顯現的清淨，即是「大般涅槃」。

「轉依」，是說出世清淨心最初現前的時候，這是無漏對治道，目的是為了對治有漏的雜染，並非為了永遠斷除雜染的種子。所以，如果說對治是轉依，這是不能成立的，因為那就變成因果無差別了。就好像聲聞的究竟果是阿羅漢，前三果雖然也是果，但還是在因地中修行對治道；又如大乘的極果是佛位，十地菩薩也還是在因中修行，都不是轉依的涅槃。若說對治就是轉依，聲聞初果（因），大乘初地以上（因），就與轉依的究竟（果），就沒有差別了。對於「斷」，是永斷，是「彼果斷」的大般涅槃；在「彼果斷」的究竟轉依上說，所以說淨心現前不就是轉依，因為尚未永斷，不然，就有因果無差別的過失了。只有建立「阿賴耶識」，有了阿賴耶的染種在，對治道雖斷其一分，它還沒有究竟轉依，就能夠建立因果的差別。所以，如果不建立賴耶，那麼在一念淨心現前時，根本就沒有雜染種子與識體，可以作為對治的所治，可以使它轉有成無。既然沒有雜染種子與識體可滅的意義，這樣的話，說「轉依」是不應道理的。唯有建立「阿賴耶識」，一切種子都在「阿賴耶識」中，可以成為能對治道所對治的對象，轉捨一切雜染分，轉依而得成清淨的法身。